La Diócesis de Huari fue creada, como Prelatura Territorial de Huari, por el Papa Pío XII, con la bula “Qui Regnum Dei” del 15 de mayo de 1958. Fue nombrado primer obispo prelado Mons. Marcos Libardoni, sacerdote de la Congregación de los Oblatos de San José.

A su muerte, el Papa Pablo VI, el 03 de agosto de 1967 nombró a Monseñor Dante Frasnelli Tarter, OSJ quien fue consagrado en Huari el 01 de noviembre de 1967, cargo que ocupó hasta el año 2001. Le sucede Mons. Antonio Santarsiero Rosa, cargo que ocupa hasta el 2004. El 29 de abril de 2004, toma posesión como nuevo Prelado Mons. Ivo Baldi.

El 2 de abril del año 2008 el Santo Padre Benedicto XVI con la Bula “Solet Apostólica Sedes” eleva a la Prelatura de Huari al rango de Diócesis y, nombra Obispo de esta nueva Diócesis a Mons. Ivo Baldi Gaburri y cómo tal tomó posesión el 08 de junio del 2008.

El 12 de diciembre de 2019 el Papa Francisco nombra obispo auxiliar de la Diócesis de Huari al R.P. Giorgio Barbetta, Rector del Seminario Señor de Pomallucay, quien fue consagrado Obispo el 11 de febrero de 2020 en Huari.

E 12 de junio de 2021, tras el fallecimiento de Mons. Ivo Baldi Gaburri, Obispo de Huari, acaecido el 11 de junio de 2021, Solemnidad del Sagrado Corazón de Jesús, el Papa Francisco nombra Administrador Apostólico de la Diócesis de Huari al Obispo Auxiliar de Huari, Mons. Giorgio Barbetta.